As reações químicas ocorrem a partir de colisões com direção e energia bem definidas entre as substâncias para formação de produtos. Entre os reagentes que se chocam e os produtos que se afastam há uma espécie de alta energia chamada Estado de Transição (ou Complexo Ativado) que possui a média das ligações que se quebram e que são formadas e que está em equilíbrio com ambos os sentidos da reação. Devido a sua alta energia possui concentração muito baixa no meio e em geral não é identificado diretamente, mas pode ser inferido indiretamente por várias medidas de cinética de reação. As estruturas dos estados de transição são representadas entre colchetes e o estado de transição é identificado por “‡”.
Em um diagrama de coordenadas de reação o estado de transição (ET) está localizado nos picos da superfície de energia potencial e o pico mais alto corresponde ao Estado de Transição Controlador da Velocidade de Reação (ETCVR) que representa a etapa lenta da reação - quanto maior for a energia do ETCVR, mais lenta será a reação. Mecanismos que tenham exatamente os mesmos passos e espécies, mas que tenham diferentes ETCVR são diferentes entre si.
Como o ET está em um equilíbrio as taxas para a formação de produtos e seu retorno são dadas por kx e k-x, respectivamente:
Os experimentos de cinética de reação tem o objetivo de determinar a estrutura mais provável do ETCVR, descrevendo assim como os reagentes se transformam em produtos.
Uma proposta de como uma reação ocorre sem o suporte cinético se chama Esquema de Intermediários e não possui o mesmo valor cientifico de um mecanismo.